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土壤、粪便、挑战性植物样本、超低起始量样本—MN RNA抽提神器

版权所有,转载请联系基因市场部
2018-09-17

RNA提取是RNA相关实验的第一步,抽提质量的好坏直接关系到后续实验是否能够顺利进行。常规样品的RNA提取已经不是困扰实验者们的痛疾,只要我们注意试验材料的收集和处理方式、选择合适的试剂盒、实验过程中RNase抑制和清除,抽提到的核酸基本都可以满足后续的qPCR、测序、基因芯片等要求。让实验者们烦恼的多是一些特殊样本的RNA提取工作。有些样本试验了多种试剂盒、优化了很多次提取流程就是提取不到想要的结果,比如土壤、粪便、FFPE、超低起始量样本等等,使得实验停步不前,甚至影响我们的毕业或者项目交付。


土壤样本

污泥、森林土壤、田地、草地、池塘等土壤RNA含量非常少,并且土壤成份复杂导致RNA极易降解,有些土壤中腐植酸的含量较高,导致提取得到的RNA不能用于后续的实验等等,这些增加了土壤样品RNA提取的难度。

 

NucleoBond® RNA Soil 土壤RNA提取试剂盒是专门为提取土壤或者沉积物中的微生物RNA而设计的。让我们更简单,更快速获得土壤中微生物RNA/DNA,应用于后续的宏基因组研究。


小编带您去看看这个试剂盒进行了哪些优化:

01

上样量提高并配备机械物理研磨珠

NucleoBond® RNA Soil采用阴离子交换技术,让裂解液重力过柱,提高了样品的上样量,一次提取可处理的土壤样品高达2g。同时由于阴离子交换技术的存在,RNA纯度也有了很大提高。


为了得到更多的RNA, NucleoBond® RNA Soil土壤RNA提取试剂盒还配备了珠磨珠和管NucleoSpin® Bead Tubes Type A,让样品裂解的更充分,释放尽量多的核酸。

02

 阴离子交换树脂技术

腐植酸是动植物经过长期的物理、化学、生物作用而形成的复杂有机物,带有羧基、酚基、酮基等活性基团,存在导致PCR失败的风险。

NucleoBond® RNA Soil采用阴离子交换技术,腐植酸会滞留在阴离子交换树脂膜上,大大的提高了样品的纯度。


应用数据:

2.png

NucleoBond® RNA Soil 可从土壤中获得可扩增RNA

MN 和Q 品牌试剂盒提取不同土壤样本(粘土,海岸土,森林土壤)RNA。将4 μL洗脱液应用于RT-PCR (扩展长度:466bp)。所有MN 提取的RNA都显示出较高得率。


粪便样品


粪便样本是一类具有挑战性的样本,其成分复杂并且不同来源的粪便差别较大。如兔子、老鼠的粪便是干便,容易吸收裂解液,导致离心后上清体积不足,所以建议上样量降低或者增加裂解液用量。人的粪便也受到饮食习惯、身体状态的影响而有很大不同。

一些高糖高脂饮食习惯的人群,粪便样本中的脂类含量很高,这样的样本会影响提取时的裂解效率,建议减少起始原料可以提高RNA的裂解效率和纯度。

NucleoSpin® RNA Stool粪便RNA核酸抽提试剂盒可以有效地从任何粪便样本中分离出高质量的RNA。

提取的核酸可直接用于PCR、qPCR、测序等。


小编带您去看看这个试剂盒进行了哪些优化:

01

特殊的化学裂解液

抽提产品包含了Nucleozol试剂和一个特殊的裂解缓冲液,用于化学裂解样品。

02

机械物理研磨珠

此外还有研磨珠用于机械破坏,保证了宿主、微生物细胞充分裂解,高效的提取效果足以应付难搞的微生物类型。

03

专利的抑制因子去除技术

专利的抑制因子去除技术(NucleoSpin® Inhibitor Removal Column)去掉粪便样品中常见的PCR抑制物。


应用数据

1.png

NucleoSpin® RNA Stool 提取的粪便RNA在qPCR中表现出色  

通过NucleoSpin® RNA Stool 和Q,Z品牌同类产品比较, 1 μL洗脱产物通过RT-qPCR检测,NucleoSpin® RNA Stool 在qRT-PCR 实验中有着更好的表现。


挑战性植物样本(多糖多淀粉或者多次级代谢物植物)


多糖多代谢物植物的提取是实验者们的另外一个比较棘手的实验。许多植物果实或者树木中含有较多的酚类和多糖或者次级代谢物。提取核酸时,酚类氧化物和次级代谢物很容易与RNA稳定的结合,影响RNA的分离纯化。糖类则是由于理化性质和RNA相似,很难将他们去除,去除过程中也会带来大量RNA流失。为了解决这个难题,除了在提取RNA材料选择方面,比如建议选择幼嫩的植物材料,优质的提取方法也成为了实验者们的追求。

NucleoSpin® RNA Plant and Fungi kit是专门为次级代谢物、糖、淀粉等核酸抽提干扰成份丰富的抽提样本设计的,可用于种子、果实、茎,根等植物各部位核酸的抽提。


小编带您去看看这个试剂盒进行了哪些优化:

01

优化的protocol

 针对常见的难提取植物,厂家给出了优化的protocol,以便得到更多核酸。

02

快速去除裂解杂质并降低粘度

试剂盒包含NucleoSpin® Plant Filters,快速去除裂解杂质并降低粘度

03

多种被验证的样本

 被验证的样本包括,云杉根、猕猴桃、土豆块茎、香蕉果肉、甜菜根,甘蔗茎、玉米粒等。


3.png

The NucleoSpin® RNA Plant and Fungi 可有效提取各类植物/真菌样本RNA



痕量样本


很多领域的研究工作需要从微量样本中抽提核酸,例如肿瘤穿刺样本、单精子、极少细胞或者单细胞样本等。这些样本中含有的核酸量极少,如果抽提不充分,不足以完成下游实验。

NucleoSpin® RNA Plus XS痕量样本抽提试剂盒让微量样本在短时间内获得更多RNA。


小编带您去看看这个试剂盒进行了哪些优化:

01

可低至单个细胞

用于微量样本,甚至单细胞中提取RNA。

02

过柱清除gDNA

 gDNA removal column 快速消化gDNA;

03

无需β- 巯基乙醇或者TCEP

04

最低的洗脱体积

 XS column 可以使洗脱体积最小达到5ul

应用数据:

4.png

不同起始量细胞中RNA得率







有了这些神器,还担心RNA样品抽提不好嘛!

或许看到这里您还没有发现自己抽提样本的神器,请不要伤心,后面还有关于FFPE样本,病毒样本,法医样本等核酸抽提神器的介绍。或者您可以联系身边的基因人,定制属于您的特殊样本核酸抽提方式。





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