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单分子RNA FISH,荧光原位杂交新时代

版权所有,转载请联系基因市场部
2019-06-28


基因表达研究中,单个细胞的特征常常有别于该群体的平均特征,这样的细胞异质性已经成为相关研究中不可忽视的现象。因此,近年来能够实现单分子水平RNA原位检测的FISH(smFISH)技术备受青睐。它们能够直观的实现单个细胞中RNA的定量和亚细胞水平的定位。在诸多可选技术中,Stellaris技术尤为突出!

                             ——LGC Genomics

传统的原位杂交技术局限于灵敏度、特异性不高,而大部分RNA在细胞中的拷贝数都很少,而且像一些癌症病人来源的组织穿刺样本,样本本身量就特别少,所以高灵敏度的原位杂交技术就显得尤其重要。So,单细胞单拷贝级别灵敏度的StellarisTM  RNA FISH技术无疑开启了细胞内定位RNA分子的新时代!

 

What is Stellaris RNA FISH

                         ——2011年 Nature Method



StellarisTM  RNA FISH---完整细胞或组织中的单个RNA分子同时进行检测、定位和定量的一项技术


Stellaris RNA FISH工作原理

多条相同荧光标记的探针结合到一条RNA靶标上产生一个显微镜下肉眼可见的荧光点。

操作简单,仅需一步杂交,一天内即可完成单分子RNA FISH检测。


可能有人会问,Stellaris探针如何保证特异性?

更低的假阴性:针对靶标基因设计25-48条探针,这样的设计方法可以使假阴性降到最低,因为即使有部分mRNA降解或者被结合RNA的蛋白阻碍,仍然还会有大部分充足的探针会结合到靶基因上。

更低的假阳性:只有当10个以上的探针聚集在一起时才能观测到荧光信号,即使有部分脱靶的探针也会非常弱,也会造成荧光信号的弥散而远远低于靶基因的信号。

Custom 或者 DesignReady 探针组

StellarisTM  RNA FISH提供免费的在线探针设计软件,针对目标RNA 设计最佳的Stellaris RNA FISH 探针组。同时,针对常见RNA序列,我们也提供DesignReady探针组,其经过专业的设计以及严格的生物信息学分析以确保其特异性。

在线设计链接

在线探针设计软件

https://www.biosearchtech.com/support/tools/design-software/stellaris-probe-designer

DesignReady探针组,点击查看您的基因是否是DesignReady!

https://www.biosearchtech.com/products/rna-fish/designready-stellaris-probe-sets


Stellaris RNA FISH单分子荧光原位杂交的优势

传统的原位杂交技术除了灵敏度受限,还不能做多重,无法定量,操作上也比较耗时和复杂,Stellaris RNA FISH单分子荧光原位杂交却很好的解决了这些问题。

灵敏度高:可检测单细胞、单拷贝RNA分子;

特异性好:多组探针设计,潜在脱靶效应或少数RNA降解可忽略,有效避免假阳性

操作简单:无抗体抗原结合的繁琐步骤;一天即可得到结果

适用性广:无物种限制(植物、动物、微生物等);无样本限制(细胞、组织、石蜡切片(FFPE)、全组织…);无需特殊仪器与配套试剂

探针设计灵活,荧光标记灵活

多重共定位:多靶点RNA共定位;RNA与蛋白共定位;寡核苷酸探针与其它原位技术兼容性好

应用:转录组水平的研究与探索一直是分子领域追逐的热点,RNA FISH检测手段是不可缺少的利器,而Stellaris RNA FISH更是提供了全新的单分子荧光原位杂交技术。

1

RNA分子亚细胞定位和定量

2

研究RNA分子的迁移/转位(如病毒RNA在宿主细胞内的迁移与扩散)

3

研究单细胞之间RNA表达的异质性

4

分析DNA转录位点活性

5

研究RNA作用机制:RNA-蛋白相互作用…

Combine Stellaris RNA FISH + IF


StellarisTM RNA FISH出版信息: 

Stellaris RNA FISH技术近年来已得到了越来越多的科研工作者认可,引用的paper超过33%发表于Nature、Science、Cell及其子刊上!

请访问Citation Center 网站获取完整的文献列表信息。

https://www.biosearchtech.com/support/resources/stellaris-citation-center


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利用Stellaris smFISH原位杂交揭示多分体病毒侵染机制

Nature Communications: 利用单分子荧光原位杂交揭示LncRNA调控植物春化作用机制

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