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PacBio Sequel单分子实时测序系统

PacBio Sequel System

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详细描述:

PacBio Sequel第三代单分子实时测序系统,不同于市面上其它基于模板PCR扩增后才能进行测序的系统,其核心技术是单分子测序技术,无需对模板DNA 进行扩增,使研究者第一次能够大规模、平行、连续地实时观测到单个DNA 聚合酶对每个模板序列的合成,进行碱基序列测定。在测序性能方面还具有以下突出优势:

1. 无于伦比的长读长(平均读长可达10-18kbp,最长60Kb)大幅提高定位准确性及拼接效率,大大简化后续的生物信息学数据处理。有利于阐释基因组所发生的变异以及大尺度结构重排等信息。

2. 单分子实时检测,无需PCR扩增,避免PCR引入的系统误差及对扩增片段的偏好性引起的信息缺失。每一条模板链都可获得相应序列信息,数据覆盖均匀,准确; 还可以检测包括稀有变异在内的各种突变型,反映各种突变型的频率。

3. 无需PCR,覆盖深度几乎不受序列中GC含量差异的影响,可测定高GC含量的区域,高度重复片段区域,100% A+T序列等基于模板PCR的测序技术难以逾越的区段。

4. 可同时获得聚合酶反应动力学信息,进行甲基化等修饰碱基的直接测定,还可区分不同基团的甲基化修饰及其它碱基修饰。


大小:W 92.7m×D 81.36cm×H 167.64cm

重量:381.47kg

环境温度:19ºC – 25ºC ± 2°C per hour

湿度:20% – 80%, 非冷凝

读长:序列平均读长1000bp-18000bp,最长读长可大于60 kb; 

建库:测序过程及建库无需PCR扩增模板,可实现单分子测序,不会因为PCR产生测序误差;

测序通量:每个测序单元SMRT包含一百万个零模波导孔(ZMWs),能够产生 5~10Gb/Cell。

碱基修饰:可以在测序的同时利用DNA聚合酶的动力学信息,无需亚硫酸氢盐转化,测序同时直接测定碱基修饰。

测序偏好性:测序反应结果不受GC/AT含量和回文序列影响,均匀覆盖整个基因组


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